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头孢氨苄与头孢克肟都是头孢类的抗菌素,两种药物临床抗菌谱不同。头孢氨苄是一代头孢针对革兰氏阳性菌，革兰氏阴性菌都有一定作用，抗菌作用一般，主要侧重于革兰氏阳性菌；头孢克肟是三代头孢对革兰氏阴性菌比较敏感，而且作用很强，副作用小。建议临床疾病是普通细菌感染时，一般选择头孢氨苄片的治疗效果可能会更好。如果临床疾病是社区获得性肺炎，或者是院内感染肺炎，选择头孢克肟治疗效果，往往会更好。由于这两种药是处方药，因此临床药物应用时需要遵医嘱，听取主治医生的建议。
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